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LIMS 專注您的專注

Smart Dedicated Efficient

LIMS—實驗室流程管控更精細化

2020-05-03 10:02


在全自動生物實驗室中,有一個控制全局的“大腦”負責實驗設備的調度和管理。這個大腦將根據實驗目的來進行流程的控制和優(yōu)化,讓所有儀器緊密配合,有條不紊地在最短時間內完成最多的實驗。那么它的運行邏輯是什么?

實驗調度,也就是在一定的約束條件下,對需要完成的任務,以及完成任務所需的資源進行分配與次序安排。無論是簡單的日程排布,還是復雜的項目管理,小到計算機的進程調度,大到機場的航班調度,都涉及到任務與資源的統(tǒng)籌安排,也就都需要“調度”。

實驗室智能化管理系統(tǒng)LIMS,在物理形態(tài)上是針對多種儀器設備的自動化整合。獨立的儀器設備實現了單個實驗步驟的智能化,而通過機械臂搬運,樣本可以在儀器設備之間自動化流轉,則實現了整個實驗流程的自動化。

實驗室智能化中,對樣本的操作,例如移液(pipetting)、溫育(incubation)等,即為「調度」需要完成的“任務”,而這些操作所占用的儀器設備,則為「調度」完成任務所需的“資源”。

傳統(tǒng)工業(yè)自動化中,為了追求較高的生產效率,產線的作業(yè)流程通常是反復優(yōu)化后的固定流程。而對于生命科學實驗室而言,其自動化系統(tǒng)需要進行多種多樣的實驗,作業(yè)流程通常是用戶配置的可變流程。因此,工業(yè)自動化通常是“剛性”產線,而實驗室智能化則相當于“柔性”產線。

實驗室智能化管理系統(tǒng),雖然形態(tài)上是設備集成,但本質上更像一種多層級的復雜設備。在這一復雜設備中,被集成的儀器設備是下層的執(zhí)行單元,它們負責執(zhí)行具體的實驗操作;而這些執(zhí)行單元如何有效的協(xié)同工作,則由更上層的控制器統(tǒng)籌調度。

目前,實驗室智能化解決方案的提供圖形化拖拽的方法,用于實驗流程的定義,用戶可以靈活方便的對實驗流程進行修改。

控制器提供的圖形化拖拽方法,相當于一種特殊的編程語言,用戶藉此語言可以對實驗流程進行“柔性”定義。

只有上層的控制器具備高效可靠的調度能力,整個智能化系統(tǒng)才能靈活應對實驗流程的“柔性”。

實驗室智能化的目的在于提高工作效率,實驗室智能化的關鍵則在于實現“高通量”。

在單通量的實驗中,一般很少涉及資源沖突的問題,而在多通量的實驗中,不同通量的不同任務常常占用同一種設備資源,在這種情況下,資源沖突就不可避免。

資源沖突如果不能合理化解,多個實驗通量同時進行時,甚至有可能因為互斥而出現“鎖死”。

實驗室智能化正是在于解決這種多通量實驗中的資源沖突,確保每個實驗通量都能有條不紊的進行。

有過實驗經歷的人一定非常清楚,真實的實驗過程通常不是一帆風順的,而是會充滿許多意想不到的波折。即使實現了自動化,這種“波折”依然可能存在。

例如,進行實驗流程的排布時,采用的是設備預估的運行時間,但設備實際的運行時間與預估時間相差許多;

再如,設備在運行過程中出現了“可恢復性錯誤”(Recoverable Error),需要在用戶干預后繼續(xù)運行;

又如,某個設備在運行過程中出現了故障,無法繼續(xù)參與實驗,實驗只能在其余的設備上進行。

實驗室智能化管理系統(tǒng),像是一種特殊的產線,與傳統(tǒng)的工業(yè)產線相比,它最突出的特點在于作業(yè)流程的多變。除了實驗中出現的“意外”情況,某些實驗場景下,還可能需要根據特定的條件判斷來對實驗流程做動態(tài)的切換。

解決實驗室管理的問題,必須首先考慮其特殊性,并根據其特點進行建模。對問題模型進行合理的抽象與構建,是解決問題的前提與關鍵。

實驗室管理平臺目前已自主研發(fā)出應用于實驗室智能化軟件,能夠對靈活定義的復雜實驗流程進行調度,可有效處理資源占用沖突、流程時間約束、設備池資源分配等實驗并行運行的關鍵問題,且具備動態(tài)管理的能力,作為實驗室自動化系統(tǒng)的“中樞”,能夠高效地對實驗設備與試劑耗材進行調度與管理,實現實驗的高通量運行。未來,自動化技術將推動實驗室高效運作,實驗室智能化應用更好地應用到實驗室管理,為檢測行業(yè)輸出更多高效、專業(yè)的自動化解決方案。

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